Project Description
Presentación
Desde que se llevó a cabo la secuenciación completa del genoma humano, cada vez son más los grupos de investigación biomédica que realizan análisis genéticos en sus proyectos de investigación. Ello es debido a que, gracias a este logro, se le facilitó a la comunidad científica una importantísima cantidad de información que los investigadores tienen el deber de aprovechar. El INIBIC no ha sido ajeno a todo ello y, por eso, este centro pretende proporcionar una plataforma que dé servicio y cobertura a todos aquellos grupos de investigación que así lo necesiten.
La plataforma de genómica del INIBIC se enmarca dentro de la Unidad de Investigación del CH Universitario A Coruña y está ubicada físicamente en el Centro de Investigación Biomédica del Hospital. Esta unidad central inició su actividad el 1 de Enero del año 2007, y desde su formación y puesta en marcha, han sido numerosos los grupos de investigación del Hospital que se vieron beneficiados de sus servicios. El equipamiento de dicha unidad central ha sido financiado gracias a ayudas públicas de diversas entidades, entre las que cabe destacar el Fondo de Investigación Sanitaria o la Xunta de Galicia.
A nivel descriptivo es una plataforma que cuenta con un equipamiento adecuado para llevar a cabo la mayoría de técnicas de biología molecular más comunes hoy en día, con unas normas de uso bien establecidas y personal técnicamente cualificado.
El objetivo principal de la plataforma es proporcionar recursos técnicos como servicio de apoyo a la investigación:
- Asesoramiento técnico y humano para estudio de viabilidad de proyectos de investigación que incluyan aproximaciones desde el punto de vista de la genómica.
- Desarrollo de un amplio abanico de técnicas moleculares (ver Servicios)
En definitiva, la existencia de la plataforma de genómica posibilita la realización de estudios genómicos con garantías gracias a que el personal del INIBIC está lo suficientemente cualificado para llevar a cabo la realización de los experimentos y el mantenimiento y ajuste de los aparatos, así como para el asesoramiento a los usuarios y la colaboración a la hora de interpretar los resultados obtenidos.
Personal
Equipamiento
La dotación de equipamiento de la unidad central de genómica ha sido posible gracias a la financiación del Instituto de Salud Carlos III, principalmente mediante ayudas de infraestructura, así como de la Xunta de Galicia. En la actualidad, esta plataforma cuenta con:
Sistemas de amplificación de ácidos nucleicos
Responsable : Ignacio Rego Pérez
PCR cuantitativa a tiempo real, modelo LightCycler 480 de Roche
Dos termocicladores de gradiente modelo Verity de Applied Biosystems
Dos termocicladores convencionales, uno modelo Primus 96 y otro modelo GeneAmp 9700 de Applied Biosystems
Sistemas de cuantificación y calidad de ácidos nucleicos y proteínas
Sistema de homogeneización de tejidos
Un espectrofotómetro Nanodrop ND-1000
Responsable : Ignacio Rego Pérez
Un Bioanalizador Agilent 2100
Responsable : Sara Relaño Fernández
Un molino mezclador MM200 y un homogeneizador Ultraturrax T10 para la disgregación de tejidos
Responsable : Mercedes Fernández Moreno
Secuenciación de ADN
Responsable : Ignacio Rego Pérez
Un secuenciador automático de tecnología capilar, modelo SeqStudio, de ThermoFisher Scientific
La plataforma también dispone de un equipo de secuenciación masiva Ion S5XL y un robot para la elaboración automática de librerías de secuenciación y template, el Ion Chef, de ThermoFisher Scientific
Electroforesis
Sala de electroforesis con cubetas y sistema de documentación de geles de agarosa
Responsable : Sara Relaño Fernández
Balanza de precisión modelo FV-120
Responsable : Sara Relaño Fernández
Otra infraestructura
- Congeladores (-80ºC, -20ºC) y neveras (4ºC) y otros útiles de laboratorio
Además, los laboratorios de investigación del INIBIC cuentan también con la infraestructura necesaria para:
- Aislamiento y cultivo celular: campanas de flujo laminar, estufas para cultivo celular, centrífugas (algunas refrigeradas) y agitadores termoregulados
- Estudio de histomorfometría: criostato, microtomo automatizado, inclusor automático de parafina, microscopio de luz y luz polarizada, tissue array
- Citometría de flujo: 2 citómetros y un sorter
Servicios ofertados
Técnicas básicas de biología molecular, destacando
- Aislamiento y cuantificación de ácidos nucleicos (ADN y ARN) a partir de cualquier tejido
- Aislamiento de ADN plasmídico
- Purificación de productos de PCR
- Realización de geles de agarosa
- Ensayos con enzimas de restricción
Técnicas basadas en secuenciación automática de ADN
- Secuenciación de productos de PCR
- Análisis de fragmentos
- Estudio de microsatélites
- Genotipado multiplex
- Estudios de filiación
Análisis bioinformático de datos de microarrays
Técnicas basadas en PCR
- Puesta a punto y realización de PCR convencional
- Diseño de cebadores
- Optimización de las condiciones de reacción
- Diseño de experimentos de expresión génica mediante PCR cuantitativa
- Cuantificación absoluta de número de copias
- Diseño de curvas patrón
- Análisis de datos
- Cuantificación relativa usando genes de referencia
- Selección de genes de referencia
- Diseño de cebadores
- Condiciones de reacción
- Análisis de datos de expresión
- Estudios de genotipado sencillos
- Genotipado con sondas Taqman
- Genotipado con sondas de hibridacion
- Cuantificación absoluta de número de copias
Tarifas
| Servicio | A | B | C |
|---|---|---|---|
| Aislamiento de ácidos nucleicos (precios por muestra) | |||
| Extracción de ADN (autoservicio) | 2€ | ND | ND |
| Extracción de ADN (con técnico) | 4€ | 6€ | 9€ |
| Extracción de ARN total (autoservicio) | 2,25€ | ND | ND |
| Extracción de ARN total (con técnico) | 6€ | 9€ | 15€ |
| Geles de agarosa | sin cargo | sin cargo | sin cargo |
| Secuenciación de ADN con tecnología capilar | |||
| Secuenciación de ADN (precio por secuencia) (sin purificación previa del producto de PCR) | 1,8€ | 3,3€ | 4,8€ |
| Secuenciación de ADN (placa de 96 completa) (sin purificación previa del producto de PCR) | 120€ | 220€ | 320€ |
| Purificación de PCR con ExoSap-IT (por muestra) (autoservicio) | 0,50€ | ND | ND |
| Purificación de PCR con ExoSap-IT (por muestra) (con técnico) | 0,95€ | 1,3€ | 1,85€ |
| Purificación de PCR a partir de gel (por muestra) (autoservicio) | 2,2€ | ND | ND |
| Purificación de PCR a partir de gel (por muestra) (con técnico) | 3,5€ | 5,5€ | 8€ |
| Análisis de SNPs (precio/muestra hasta un máximo de 8 SNPs) | 1,9€ | 3,9€ | 5,5€ |
| Análisis de microsatélites(sin kit de secuenciación) | 0,9 € | 2,8 € | 3,9 € |
| Análisis de microsatélites(con kit de secuenciación) | consultar | consultar | consultar |
| PCR y PCR cuantitativa (precios por muestra) | |||
| Diseño de oligonucleótidos | sin cargo | sin cargo | sin cargo |
| Amplificación de ADN por PCR (autoservicio) | 0,8€ | ND | ND |
| Amplificación de ADN por PCR (con técnico) | 1,5€ | 2,2€ | 4€ |
| qPCR a tiempo real, SYBR Green (por duplicado en placa y 1 gen ref) (autoservicio) | 1,5€ | ND | ND |
| qPCR a tiempo real, SYBR Green (por duplicado en placa y 1 gen ref) (con técnico) | 2,1€ | 3€ | 5,9€ |
| qPCR a tiempo real, sondas UPL (por duplicado en placa y 1 gen ref) (autoservicio) | 1,8€ | ND | ND |
| qPCR a tiempo real, sondas UPL (por duplicado en placa y 1 gen ref) (con técnico) | 2,5€ | 4,7€ | 7,9€ |
| Reacción de retrotranscripción kit NZY-RT (autoservicio) | 4€ | ND | ND |
| Reacción de retrotranscripción kit NZY-RT (con técnico) | 5,5€ | 7€ | 9€ |
| Reacción de retrotranscripción kit Roche (autoservicio) | 6€ | ND | ND |
| Reacción de retrotranscripción kit Roche (con técnico) | 8€ | 14,64€ | 20€ |
| Reacción de retrotranscripción kit Vilo (autoservicio) | 11€ | ND | ND |
| Reacción de retrotranscripción kit Vilo (con técnico) | 15€ | 27€ | 38€ |
| Genotipado de SNPs | consultar | consultar | consultar |
| Cuantificación/pureza de ácidos nucleicos y proteínas | |||
| Cuantificación ADN/ARN por NanoDrop (por muestra) (autoservicio) | 0,05€ | ND | ND |
| Cuantificación ADN/ARN por NanoDrop (por muestra) (con técnico) | 0,33€ | 0,48€ | 0,68€ |
| Análisis de ARN por Bioanalizador 2100 (por chip) (autoservicio) | 29€ | ND | ND |
| Análisis de ARN por Bioanalizador 2100 (por chip) (con técnico) | 39€ | 47€ | 78€ |
| Análisis de ADN por Bioanalizador 2100 (por chip) (autoservicio) | 29€ | ND | ND |
| Análisis de ADN por Bioanalizador 2100 (por chip) (con técnico) | 39€ | 47€ | 78€ |
| Análisis de proteínas por bioanalizador 2100 (por chip) (autoservicio) | 29 € | ND | ND |
| Análisis de proteínas por bioanalizador 2100 (por chip) (con técnico) | 39 € | 47 € | 78 € |
| Análisis bioinformático/bioestadístico de datos | |||
| Precio por hora | 27€ | 33€ | 50€ |
| Otros servicios | |||
| Test de Mycoplasma en cultivos celulares (precio por muestra) | 1,8 € | 2,3 € | 4,1 € |
Tarifa A INIBIC y grupos asociados.
Tarifa B Resto de centros y organismos de investigación públicos.
Tarifa C Empresas y entidades privadas.
ND Servicio no disponible
Consultar disponibilidad y precio para servicios no incluidos en este listado.
Consultar requisitos en la preparación y envío de muestras para su análisis.
Solicitudes
La Plataforma de Genómica del INIBIC ofrece un servicio de apoyo a la investigación a los laboratorios miembros del Instituto, así como a otras instituciones públicas o privadas. La lista de tipos de análisis que se ofertan puede consutarla en la sección Servicios ofertados
Procedimientos para la solicitud de los servicios
La solicitud de un servicio puede realizarse rellenando el/los Formulario/s de Solicitud correspondientes, disponibles en esta misma página. Una vez cumplimentados se enviarán por fax o correo electrónico, junto con las muestras a analizar.
Es necesario rellenar el formulario de Solicitud de Servicio de la Plataforma de Genómica, y uno de los formularios específicos de cada tipo de análisis.
Solicitud de Servicio de la Plataforma de Genómica
En el caso de solicitar únicamente presupuesto para un análisis en concreto, puede cumplimentarse el formulario de Solicitud de Presupuesto de la Plataforma de Genómica
Envío de muestras
Una vez cumplimentada la solicitud, las muestras a analizar se podrán entregar de cualquiera de las siguientes formas:
- Mediante servicio de mensajería con portes pagados o correos a la dirección indicada en la sección de contacto
- Entrega directa en el laboratorio: Edificio anexo al Hospital Materno Infantil Teresa Herrera, planta baja
Antes de su envío, es indispensable seguir las Instrucciones para el envío de muestras que se encuentran en esta página web.
Entrega de resultados
Instrucciones para el envío de muestras
El material con el que se trabaja en la plataforma de genómica es principalmente ADN o ARN, el cual puede ser enviado como tal a la plataforma o, por el contrario, puede enviarse el tejido de origen o pellet celular, llevándose a cabo la extracción del material genético en el propio laboratorio.
Envío de muestras de tejido para ensayos con ARN
Envío de muestras de tejido para ensayos con ADN
Envío de células en cultivo
Envío de ADN
Envío de ARN
Contacto
La Plataforma de Genómica se encuentra en la planta baja del edificio del Instituto de Investigación Biomédica (INIBIC), anexo al Hospital Materno-Infantil Teresa Herrera de A Coruña.
Plataforma de Genómica INIBIC-CHUAC
Hospital Teresa Herrera (Edificio anexo – Planta Baja)
Xubias de Arriba, 84
15006 A Coruña
Teléfono: 981 17 82 72
Fax: 981 17 82 73
Coordenadas: 43º20’39”N 8º23’20”W
